Shpërndarja bivariate von Mises
Në teorinë e probabilitetit dhe statistikë, shpërndarja bivariate von Mises është një shpërndarje probabiliteti që përshkruan vlerat në një torus . Mund të mendohet si një analog në torusin e shpërndarjes normale dyndryshore . Shpërndarja i përket fushës së statistikave të drejtimit . Shpërndarja e përgjithshme dyndryshore von Mises u propozua për herë të parë nga Kanti Mardia në 1975. [1] [2] Një nga llojet e tij përdoret sot në fushën e bioinformatikës për të formuluar një model probabilistik të strukturës së proteinave në hollësi atomike, [3] [4] të tilla si libraritë rotamere të varura nga shtylla kurrizore .
Përkufizimi
[Redakto | Redakto nëpërmjet kodit]Shpërndarja dyndryshore von Mises është një shpërndarje probabiliteti e përcaktuar në tor, në . Funksioni i dendësisë së probabilitetit të shpërndarjes së përgjithshme të dyndryshore von Mises për këndet jepet nga [1]
ku dhe janë mesataret për dhe , dhe përqendrimi i tyre dhe matrica lidhet me korrelacionin e tyre.
Dy variante të përdorura zakonisht të shpërndarjes dyndryshore në fjalë janë lloji sinus dhe kosinus.
Varianti kosinus i shpërndarjes dyndryshore von Mises [3] ka funksionin e dendësisë së probabilitetit
ku dhe janë mesatare për dhe , dhe përqendrimi i tyre dhe lidhet me korrelacionin e tyre. është konstanta e normalizimit. Kjo shpërndarje me =0 është përdorur për vlerësimet e dendësisë së bërthamës të shpërndarjes së këndeve dihedrale të proteinave dhe . [4]
Varianti sinus ka funksionin e dendësisë së probabilitetit [5]
- ^ a b Mardia, Kanti (1975). "Statistics of directional data". J. R. Stat. Soc. B. 37 (3): 349–393. JSTOR 2984782.
{{cite journal}}
: Mungon ose është bosh parametri|language=
(Ndihmë!) Gabim referencash: Invalid<ref>
tag; name "jjjj" defined multiple times with different content - ^ Mardia, K. V.; Frellsen, J. (2012). "Statistics of Bivariate von Mises Distributions". Bayesian Methods in Structural Bioinformatics. Statistics for Biology and Health. fq. 159. doi:10.1007/978-3-642-27225-7_6. ISBN 978-3-642-27224-0.
{{cite book}}
: Mungon ose është bosh parametri|language=
(Ndihmë!) - ^ a b Boomsma, W.; Mardia, K. V.; Taylor, C. C.; Ferkinghoff-Borg, J.; Krogh, A.; Hamelryck, T. (2008). "A generative, probabilistic model of local protein structure". Proceedings of the National Academy of Sciences. 105 (26): 8932–7. Bibcode:2008PNAS..105.8932B. doi:10.1073/pnas.0801715105. PMC 2440424. PMID 18579771.
{{cite journal}}
: Mungon ose është bosh parametri|language=
(Ndihmë!) Gabim referencash: Invalid<ref>
tag; name "WB08" defined multiple times with different content - ^ a b Shapovalov MV, Dunbrack, RL (2011). "A smoothed backbone-dependent rotamer library for proteins derived from adaptive kernel density estimates and regressions". Structure. 19 (6): 844–858. doi:10.1016/j.str.2011.03.019. PMC 3118414. PMID 21645855.
{{cite journal}}
: Mungon ose është bosh parametri|language=
(Ndihmë!) Gabim referencash: Invalid<ref>
tag; name "Shapovalov" defined multiple times with different content - ^ Singh, H. (2002). "Probabilistic model for two dependent circular variables". Biometrika. 89 (3): 719–723. doi:10.1093/biomet/89.3.719.
{{cite journal}}
: Mungon ose është bosh parametri|language=
(Ndihmë!)